平凡的中学生鹿目圆有一个美满的家庭，在生活中她是个性格温顺又有爱心的好孩子。转学生晓美焰的出现打破了小圆平静的生活，这个性格酷酷又体弱多病的黑长直少女似乎对小圆有着什么难言之隐。命运中的相遇出现了，小圆在路边救下了一只浑身是伤的奇怪动物 ，没想到这只动物居然会说人类的语言。它告诉小圆它的名字叫丘比，并且提出了一个特殊的要求，它希望小圆能够和它签订契约成为魔法少女。魔法少女是这个世界中一种特殊的存在，她们肩负着和魔女战斗的使命，作为报酬，丘比可以实现她们任意的一个愿望。经过一系列事件后，小圆最终决定成为一名魔法少女。
