กล่าวถึงโลกที่มนุษย์จำเป็นต้องอาศัยบนพื้นน้ำทั้งจากปัญหาสภาพอากาศและกองเรือแห่งหมอกที่แข็งแกร่ง เวลาผ่านไป 17 ปี มนุษย์ได้คิดค้นอาวุธที่สามารถสู้กับกองเรือแห่งหมอกได้ แต่ทว่าประเทศญี่ปุ่นที่คิดค้นนั้นไม่มีกำลังพอจะผลิตจำนวนมาก จึงต้องจ้างวาน กุนโซ ผู้ที่ได้ครอบครองเรือดำน้ำลาดตระเวนสีน้ำเงิน I-401 (อิ401) ที่เขาได้รับมาด้วยเหตุผลบางอย่าง เขาได้กลายเป็นความหวังสุดท้ายของมนุษยชาติในการต่อกรกับกองเรือปริศนาเหล่านั้น
