Członkowie elitarnego oddziału G.I. Joe zostają oskarżeni o zbrodnię, której nie popełnili. Uciekając przed wymiarem sprawiedliwości usiłują dopaść prawdziwych winowajców. Trop wiedzie do potężnej korporacji znanej jako Cobra Industries - w rzeczywistości organizacji terrorystycznej, kierowanej przez szaleńca, marzącego o stworzeniu nowego porządku na Ziemi...
