Kyle XY: een verhaal over een zestienjarige jongen met een geest van een genie. Hij wordt al zwervend over straat gevonden en hij heeft geen herinnering van wie hij is of waar hij vandaan komt. Hij wordt al snel meegenomen naar een jeugdgevangenis, waar hij de psycholoog Nicole Trager ontmoet. Ze ziet dat Kyle deze verbazingwekkende vaardigheden heeft. Binnen afzienbare tijd wil ze hem mee naar huis nemen, naar haar man en twee kinderen. Stephen heeft in eerste instantie zijn twijfels over Kyle. Tijdens het verblijf bij de Tragers begint Kyle zijn verleden te herinneren en hij is bereid om alles te geven om zijn verleden te ontgrendelen.
